Фамилия Денисеня — яркий пример того, как по суффиксу можно безошибочно определить географию её происхождения. Окончание «-еня» (вместо привычного «-енко» или «-евич») указывает на западно-белорусские или, реже, польские земли. Такая модель патронимического суффикса характерна для Гродненской, Брестской и Минской областей, где под влиянием польского языка отчества приобретали форму на «-еня»: Иван → Иваненя, Денис → Денисеня. Так что перед нами не великорусская, а именно западнорусская фамилия, сохранившая местный говор.

Основа фамилии — крестильное имя Денис, народная форма греческого Дионисий. В православных святцах имя связано с Дионисием Ареопагитом, но в быту на Руси оно давно обрусело и стало одним из самых распространённых. Фамилия Денисеня буквально означает «потомок Дениса» или «Денисов сын». Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Денисеня́, что тоже типично для белорусской фонетики.

В отличие от фамилий на «-ов» или «-ин», которые закрепились в среде московских служилых людей, модель на «-еня» долго оставалась фамилией-прозвищем, то есть не передавалась по наследству строго, а прикреплялась к конкретному сыну Дениса. Лишь к концу XIX века, после отмены крепостного права и с развитием паспортной системы, такие формы застыли в качестве родовых имён. Поэтому предки носителя фамилии Денисеня — скорее всего, крестьяне или мещане западных губерний Российской империи, где имя Денис было особенно популярно.

Известных носителей с такой фамилией в общероссийских энциклопедиях нет, что неудивительно: фамилия редкая, локальная. Встречается она и в современной Беларуси, и среди потомков эмигрантов в Польше, Литве и даже в США, куда в начале XX века уезжали белорусские крестьяне. Если ваш предок носил фамилию Денисеня, ищите корни в деревнях Гродненщины или Полесья — там она бытовала как естественная, живая форма, а не искусственное канцелярское новообразование.