Фамилия Денискова — это женская форма, а её мужской вариант — Денисков. В основе лежит имя Дениска, которое в старину было не просто уменьшительной формой от Денис, а самостоятельным обиходным вариантом. Церковное имя Денисий (от греческого Дионисиос — посвящённый богу виноделия Дионису) в русском языке дало множество производных: Денис, Дениска, Денисей, Денисюк. Фамилия образована по простой и продуктивной модели: к основе Дениск- добавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей сын?» — Денисков). То есть предок носительницы фамилии — человек по имени Дениска.

Суффикс -ов типичен для центральных и северных регионов России. Однако в случае с Денисковым есть одна особенность: в русском языке имена, оканчивающиеся на -ка, обычно дают фамилии на -ин (Денискин, Федькин). Вариант Денисков встречается реже и может указывать на два обстоятельства. Первое: основа могла быть не от Дениска, а от полного имени Денис с наращением -к- в основе — так иногда закрепляли прозвищные формы в документах. Второе: это могла быть описка или диалектная черта — в некоторых говорах предпочитали суффикс -ов даже для имён на -а.

Географически фамилия Денисков (и Денискова) тяготеет к южным областям — Воронежской, Ростовской, а также встречается на Урале. Это не слишком распространённая фамилия, что говорит о её относительно позднем закреплении (XVII–XVIII века), когда крестьянам начали массово присваивать фамилии по отцу. Среди носителей не было знати — это фамилия крестьянская или посадская. Её носитель мог быть сыном Дениски, который, в свою очередь, мог быть и крестьянином, и ремесленником, и служилым человеком низшего ранга.

В написании важно не путать с фамилией Денискова (ударение на и) и Денисова — последняя образована от полного имени Денис и гораздо более частотна. Денисков — редкий случай, когда уменьшительная форма закрепилась в фамилии именно с суффиксом -ов, что делает её интересным объектом для ономастики: здесь смешались две словообразовательные модели, и победила менее ожидаемая.