Фамилия Деркунова — женская форма фамилии Деркунов, и её происхождение стоит искать в прозвище или имени дальнего предка по мужской линии. Основа фамилии — «Деркун» — слово, которое в русских говорах имело вполне конкретное значение. В словарях диалектной лексики «деркун» — это либо тот, кто дерет (например, лен или шерсть), то есть работник, занятый обработкой волокна, либо, что вероятнее, задиристый, драчливый человек, забияка. Корень «дер-» (драть) в переносном смысле означал «драться», «задираться», поэтому прозвище Деркун могли дать сварливому или бойкому человеку.

Суффикс -ун в основе — типичный для русских прозвищ, обозначающих деятеля по характерному действию (ср. бегун, крикун, молчун). Фамилия образована по стандартной патронимической модели: Деркун → Деркунов (чей сын? — Деркунов) → Деркунова. Такая модель в XVI–XVII веках закрепилась в центральной России, а позднее — на Урале и в Сибири, куда переселенцы несли свои фамилии. Фамилия Деркунов (и Деркунова) не относится к числу частых, но встречается в документах по Курской, Орловской и Воронежской губерниям, что указывает на южнорусские корни.

Интересная деталь: в некоторых областях «деркуном» называли также неубранное, заросшее поле или запущенную пашню — от глагола «драть» в значении «корчевать, расчищать землю под пашню». В таком случае прозвище могло закрепиться за крестьянином, который осваивал новину, то есть драл целину. Однако более распространённая версия — именно прозвище по характеру или ремеслу, так как фамилии на -ун чаще описывают человека, а не объект.

Встречается и вариант написания «Деркунова» с ударением на второй слог — Дерку́нова, что характерно для южных говоров. Фамилия не имеет отношения к дворянским родам и, скорее всего, происходит из крестьянской или однодворческой среды. Однофамильцев, оставивших заметный след в истории, не зафиксировано — это рядовая, но выразительная русская фамилия, в которой слышится живая народная речь.