Фамилия Диконтий — редкая, и её происхождение неочевидно, что и делает её особенно интересной для разбора. В отличие от большинства русских фамилий на «-ов» или «-ин», она имеет окончание «-ий», что сразу указывает на польское, украинское или белорусское влияние. Такая модель (с суффиксом «-ий») типична для фамилий, образованных от прилагательных или прозвищ.

Самая вероятная версия связывает основу фамилии с латинским словом decanus (десятник, старший над десятью монахами, позже — церковная должность). В польском языке это слово дало формы dziekan (декан) и dziekania (деканат). Фамилия Диконтий могла возникнуть как русифицированная или украинизированная форма польской фамилии Dziekoński или Dziekanowski. В таком случае предок носителя был либо церковным деканом, либо происходил из местности, названной в честь этого чина (например, село Дзеканово). Суффикс «-тий» здесь — результат адаптации польского «-ski» в восточнославянской среде, где «Дзеканский» превратилось в «Диконтий» через упрощение звуков и замену суффикса.

Менее вероятная, но возможная версия — от греческого διάκονος (диакон, служитель). В этом случае фамилия могла принадлежать потомку дьякона, но тогда ожидалась бы форма вроде «Диаконов» или «Дьяконов». Форма «Диконтий» с твёрдым «т» и окончанием «-ий» скорее указывает на западное, а не греческое влияние. Можно предположить и искусственное происхождение — в семинарской среде, где будущим священникам давали фамилии, образованные от латинских церковных терминов, чтобы подчеркнуть сан или учёность.

Географически фамилия тяготеет к западу России и Украины. В дореволюционных источниках носители фамилии Диконтий встречались среди мещан и духовенства Черниговской, Киевской и Волынской губерний. Это подтверждает версию о польско-украинских корнях: именно на этих землях фамилии на «-ий» были массовыми, а латинские церковные термины — привычными.

Единичные случаи бытования фамилии в Сибири и на Урале — скорее результат миграции конца XIX века, когда крестьяне и ссыльные переселенцы увозили свои редкие фамилии на восток.

Сегодня фамилия Диконтий остаётся малочисленной. Её носители — это, скорее всего, потомки церковнослужителей или шляхты, чьи предки жили на землях бывшей Речи Посполитой. В отличие от шаблонных объяснений, здесь нет простого «прозвища от профессии» — перед нами случай, когда фамилия прошла через несколько языков и культур, сохранив в себе латинский корень, польский суффикс и русскую огласовку.