Фамилия Додонкина — женская форма фамилии Додонкин, и её разбор стоит начать с суффикса, который сразу выдаёт её северное или восточное происхождение. Суффикс -ин (а не -ов) указывает на то, что основа фамилии — личное имя или прозвище, оканчивающееся на гласный или мягкий согласный. В данном случае это слово «Додонка» — уменьшительная форма от имени или прозвища Додон.

Корень «Додон» — один из самых спорных в русской ономастике. Самая правдоподобная версия связывает его с тюркским «додон» или «дудун» — так в некоторых тюркских языках называли начальника, правителя или судью. В русских говорах слово закрепилось как прозвище для важного, медлительного или ворчливого человека, иногда с оттенком насмешки: «додон» — увалень, неповоротливый. В словаре Даля зафиксировано слово «додон» в значении «нескладный, мешковатый человек», что подтверждает бытовую, а не возвышенную природу прозвища.

Модель образования проста: прозвище Додон → уменьшительное Додонка (человек, которого так называли в семье или в округе) → притяжательное прилагательное Додонкин («чей?» — сын Додонки) → фамилия Додонкин. Женская форма Додонкина закрепилась за женщинами в семье или за вдовой.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России: встречается в старых переписях Вологодской, Вятской и Костромской губерний. Это косвенно подтверждает версию о бытовом прозвище — именно в крестьянской среде таких «додонов» было много, и фамилия могла закрепиться за целым родом, где главу семьи прозвали за характер или внешность.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ов, которые часто образовывались от полных имён (Иванов), фамилия Додонкин стоит в ряду тех, что произошли от прозвищного уменьшительного имени. Это указывает на то, что предок носителя фамилии был не просто «Додоном», а «Додонкой» — возможно, младшим или зависимым членом семьи, которого так называли в быту. Такой словообразовательный нюанс делает фамилию более личной, интимной, чем, скажем, Додонов.