Фамилия Долгушена — редкий случай, когда написание через «е» в суффиксе (-ен-) прямо указывает на происхождение. Большинство русских фамилий на -ин образованы от основ на -а/-я (Долгуша → Долгушин). Форма Долгушена — это не опечатка и не вариант, а женская форма фамилии Долгушен, которая, в свою очередь, восходит к прозвищу Долгуша, но с другим суффиксом. Если Долгушин — «чей-то сын Долгуши», то Долгушен (а от него — Долгушена) — «чей-то сын Долгуши», но оформленный с помощью суффикса -ен-, характерного для кратких притяжательных прилагательных в некоторых южнорусских и украинских говорах. То есть перед нами не мужская фамилия, а исходная женская форма, закрепившаяся как фамилия, или же след западнорусской диалектной модели.

Основа — прозвище Долгуша. В русских говорах «долгушей» называли высокого, долговязого человека, иногда — того, кто медлителен («долго делает»). В словаре В. Даля зафиксировано слово «долгуша» в значении «длинный воз, дроги» или «долгая одежда», но для прозвища первичен именно рост или характер. Фамилия Долгушена, таким образом, могла означать «жена или дочь Долгуши», а её носительница — происходить из семьи, где отца или мужа прозвали за высокий рост.

Географически фамилия встречается в основном на юге России (Воронежская, Ростовская области) и в восточной Украине. Это зона, где суффикс -ен- в фамилиях (вместо -ин) — не редкость. В отличие от северного «Долгушин», форма Долгушена — маркер именно этой территории. В документах XVIII–XIX веков такие фамилии часто писали с вариациями: Долгушенко, Долгушин, Долгушов, но Долгушена сохранилась как самостоятельный оним.

Ономастический словарь Б. Унбегауна относит подобные образования к «полуотчествам»: они фиксировали не родовую принадлежность, а конкретное лицо в семье. Если вы ищете значение фамилии Долгушена, то главное — не корень «долг» (денежный долг), а именно рост: предок был долговязым.