Фамилия Дордохин образована от имени или прозвища Дордоха. В основе, скорее всего, лежит монгольское слово «дордох» — «ухудшаться», «становиться слишком низким, быть низким». У многих народов имена с негативным значением давали детям нарочно, чтобы оградить их от несчастий в будущем: считалось, что злые силы не позарятся на того, кого уже назвали «плохим» или «низким». Поэтому Дордоха могло быть охранительным, обережным именем.

Не исключено и более прозаичное объяснение. Прозвище Дордоха мог получить невысокий человек или тот, кто жил в низине, на болотистой почве. В русских говорах слово «дор» означает расчищенное место, вырубку, но в данном случае монгольский след выглядит весомее: фамилия явно восточного происхождения и могла закрепиться в тех регионах, где русские соседствовали с тюрко-монгольскими народами.

Модель образования простая и типичная для русских фамилий: суффикс -ин добавляется к основе на -а. Дордоха → Дордохин, то есть «сын Дордохи». Фамилия редкая, в массовых справочниках почти не встречается, что говорит о её узколокальном бытовании — вероятно, где-то на юге Сибири, в Забайкалье или в Поволжье, где исторически сильны монгольские влияния.