Фамилия Дорота, скорее всего, ведет происхождение от полной или уменьшительной формы древнерусского имени Дорофей (в церковной традиции — Доротей). Это имя, пришедшее из греческого языка, означает «божий дар» (от «дорон» — дар и «теос» — бог). Аналогичным по значению еврейским именем считается Дорон. Таким образом, в основе фамилии лежит не прозвище или ремесло, а каноническое христианское имя, которое давали ребенку при крещении.

Менее распространенная, но тоже возможная версия связывает фамилию с женским именем Доротея, образованным от того же греческого корня, что и Дорофей. В таком случае фамилия могла закрепиться за внебрачным ребенком или за человеком, воспитанным матерью, носившей это имя.

Сама фамилия Дорота — редкая и нечастотная. Она образована по бессуффиксной модели, то есть фамилией стало само имя в его усеченной или разговорной форме, без добавления типичных русских суффиксов -ов, -ин или -ский. Это указывает на то, что фамилия могла сложиться не в центральных областях России, а на западных или юго-западных землях (например, в Беларуси или на Украине), где такие «голые» фамилии встречаются чаще. В русской традиции аналогичная форма была бы, скорее, Доротин или Дорофеев.

Поскольку в основе лежит имя, а не прозвище, сословной привязки у фамилии нет: ее мог получить и крестьянин, и мещанин, и священник. Единственное, что можно утверждать наверняка — предок носителя фамилии Дорота был крещен именем Дорофей (или, реже, Доротея), а сама фамилия сохранила архаичную, почти неизмененную форму этого имени.