Фамилия Драгонат — редкий случай, когда основа, скорее всего, не русская, а польская или украинская, и связана не с драгоценностями, а с военным делом. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не «драг» (от «дорогой»), а «драгон» — так в европейских армиях называли солдата-драгуна, то есть всадника, обученного действовать и в пешем строю. В польском языке слово «dragón» (драгун) и «dragonia» (драгуны, конница) были широко распространены. Суффикс «-ат» в этой модели указывает на принадлежность или происхождение: Драгонат — это «сын драгуна» или «человек из драгунского полка». В XVIII–XIX веках, когда драгунские части активно формировались на территории Речи Посполитой, а затем и в западных губерниях Российской империи, прозвище «Драгон» или «Драгонат» могло закрепиться за отставным солдатом или его потомком.

Вторая, менее вероятная версия — происхождение от южнославянского или румынского имени Драган (от «драг» — дорогой, любимый) с добавлением суффикса «-ат». В таком случае фамилия означала бы «потомок Драгана» или «человек из рода Драгана». Но против этой гипотезы говорит то, что в русской ономастике форма «Драганов» или «Драганович» встречается чаще, а «Драгонат» — явно более редкое и специфическое образование.

Географически фамилия тяготеет к западу: её можно встретить в Беларуси, на Волыни, в Подолье, а также среди потомков польской шляхты, которая после разделов Речи Посполитой перешла на русскую службу. В дореволюционных метрических книгах Драгонаты изредка попадаются среди мещан и однодворцев юго-западных губерний. Социально это, скорее всего, не дворянская, а солдатская или казачья фамилия: драгуны в России и Польше часто вербовались из простонародья.

Если разбирать словообразовательную модель, то «Драгонат» стоит особняком: в русских фамилиях суффикс «-ат» встречается редко и обычно указывает на украинское или белорусское влияние (сравните: Бондарчук — Бондаренко, но есть и фамилии вроде Драгомат, Громат). Это делает фамилию ценной для историка: она — живой след военной реформы и миграции людей в XVIII веке.