Фамилия Дудушев — один из тех случаев, где на первый план выходит не имя, а звукоподражательное прозвище. Основа «дудуш» восходит к глаголу «дудеть» или существительному «дуда» (дудка, свирель). В русских говорах «дудуш» или «дудушка» — это либо музыкант, играющий на дудке, либо, в переносном смысле, человек, который монотонно, надоедливо говорит или бормочет. Прозвище могли дать пастуху, игравшему на рожке, или просто скучному собеседнику, которого в деревне называли «дудуш».

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: суффикс -ев присоединился к основе «Дудуш», означая «сын Дудуша» или «принадлежащий Дудушу». Форма на -ев, а не на -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий или шипящий согласный («ш»). Такая фамилия могла закрепиться в среде крестьян и посадских людей, где прозвища по профессии или поведению давали часто и охотно.

Версия о тюркском происхождении (от имени Дудуш, которое могло быть уменьшительной формой от каких-либо восточных имен) менее вероятна для фамилии с русским суффиксом -ев. Она не находит убедительного подтверждения в словарях личных имен, тогда как связь с «дудой» лежит на поверхности и объясняется из живого русского языка.

Встречается фамилия преимущественно в Поволжье и центральных областях России. Интересно, что в некоторых старых документах встречается вариант написания «Дудушевъ» с твердым знаком на конце, что не меняет произношения, но указывает на дореформенную орфографию. Родственные фамилии — Дудин, Дудкин, Дударев — все они образованы от того же корня, но с разными суффиксами, что показывает, насколько распространено было прозвище, связанное с дудкой, в разных регионах.