Фамилия Дуенко звучит как типичная восточноукраинская фамилия, и разбор её подтверждает это первое впечатление. Суффикс -енко указывает на происхождение с территории современной Украины, где такие фамилии в XVII–XVIII веках означали «сын» или «потомок» человека, названного в основе. То есть Дуенко — это буквально «сын Дуя» или «сын Дуйка».

Самая прямая и правдоподобная версия связывает основу «Дуй» с прозвищем или некалендарным именем Дуй. В древнерусской и украинской среде такие имена давали по действию: Дуй могло означать «ветреный», «легкомысленный» человек, который «дует, куда ветер подует». В говорах «дуть» также имело переносное значение — «быть заносчивым», «важничать». Менее вероятно, но возможно, что прозвище относилось к человеку, который работал с мехами (кузнец, стеклодув) или постоянно дул на что-то в быту. В любом случае, прозвище было ярким и запоминающимся, что и закрепилось в фамилии.

Встречается и версия, что основа — это форма крестильного имени Дула или Дул, но это имя редкое, и связь с действием «дуть» выглядит естественнее. Форма Дуенко могла образоваться и от украинского глагольного прозвища Дуйко — «тот, кто дует», с последующим стяжением в «Дуенко». В современных базах фамилия Дуенко встречается в основном в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев в России и Казахстане.

Таким образом, предок носителя фамилии Дуенко, скорее всего, получил своё прозвище за живой, подвижный или даже ветреный характер, а его дети и внуки стали Дуенками. Фамилия не относится к числу древних аристократических, а возникла в среде казачества или крестьянства, где прозвища по бытовым признакам были нормой.