Фамилия Духновский образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Духновский послужило мирское имя Дух. Древнеславянское имя Дух, а точнее его украинская форма — Духно, вероятно, связано со словом «дух» не в значении «сверхъестественное существо», а «душа». Слово «дух» есть во всех славянских языках. Таким образом, имя Дух или Духно буквально означало «наделенный душой», «дышащий» (или «живой»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Дух, со временем получил фамилию Духновский. О точном месте и времени возникновения фамилии Духновский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Духновский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.