Фамилия Духновский — это не просто отсылка к «духу» в мистическом смысле, а скорее семейное прозвище, закрепившееся в документах. В её основе лежит древнее славянское мирское имя Дух, бытовавшее в украинской форме Духно. В языческой традиции такие имена давали не для обозначения сверхъестественной силы, а как характеристику живого человека: «дух» здесь означал «душа», «дыхание», саму суть жизни. Имя Духно буквально понимали как «дышащий», «наделённый душой», то есть «живой».

Фамилия образована по типичной для украинских и польских земель модели с суффиксом -ский, который изначально указывал на принадлежность к местности или роду. Духновский — это буквально «потомок или выходец из рода Духновых» (где Духно — основа). Суффикс -ов- в промежуточной форме «Духнов» характерен для восточнославянской патронимии, а добавление -ский — более поздний этап, часто связанный с переходом в шляхетскую или казачью среду.

Точное место и время возникновения фамилии установить сложно: процесс формирования фамилий на территории Речи Посполитой и Гетманщины растянулся на несколько столетий. Однако сам тип фамилии на -ский говорит о том, что её носители, скорее всего, относились к социальным слоям, где ценилась «родовая» приставка — мелкопоместной шляхте, казацкой старшине или духовенству. Встречается фамилия и в варианте Духновский, и в более редком написании Духновской.

Несмотря на кажущуюся простоту, фамилия Духновский — редкий случай, когда за прозрачной основой стоит не профессия или внешность, а древнее именование, подчёркивающее саму жизненную силу человека.