Фамилия Дуникова — женская форма фамилии Дуников, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Фамилия образована с помощью патронимического суффикса -ов, что типично для русских фамилий XIX века: «чей?» — Дуников, то есть потомок человека по прозвищу Дуник. Суффикс указывает на принадлежность к роду, а не на место жительства или сословие.

Основа фамилии — Дуник — это, скорее всего, прозвище. В русских говорах слово «дуник» могло иметь два значения. Первое — человек, который дует, то есть хвастун или пустослов (от глагола «дуть» в переносном смысле). Второе — житель местности, где дуют сильные ветры, или человек с характерной манерой говорить «на дух» (резко, отрывисто). В ономастике есть и более редкая версия: Дуник — это уменьшительная форма от канонического имени Донат (через народное Дунька, Дуня), но она менее вероятна, так как суффикс -ик в прозвищах чаще указывает на признак, а не на имя.

Если посмотреть на географию, фамилия Дуников (и Дуникова) встречается в основном в центральных и северных регионах России — в Вологодской, Костромской, Ярославской областях. Это не случайно: в северных говорах слово «дуник» сохранилось в значении «задира» или «болтун». Предок носительницы фамилии мог быть человеком бойким, говорливым, возможно, не в меру хвастливым — прозвище закрепилось за ним в быту, а затем перешло в официальную фамилию.

В отличие от фамилий на -ский, которые часто указывают на дворянское происхождение, Дуниковы — типичная крестьянская или мещанская фамилия. Она не встречается в родословных книгах дворянства и не связана с географическими названиями. Это бытовое прозвище, которое стало фамилией в эпоху, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам отца (после отмены крепостного права в 1861 году). Если ваши предки носили фамилию Дуниковы, скорее всего, они были государственными или помещичьими крестьянами из северной полосы России.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Дунаев, Дудин, Дулов — показывает, что корень «ду-» в русских прозвищах часто связан со звуками (дуть, дуда, дуло) или с характером (дурак, дурень). Дуников — более редкий вариант, чем, например, Дунаев, и это делает фамилию ценной для генеалогического поиска: чем реже фамилия, тем легче отследить её носителей по архивам.