Фамилия Дунио, предположительно, образована от аналогичного прозвища, восходящего к топониму Дунье (Дуние, Дуния). Так назывался населенный пункт, расположенный в бывшей Ковенской губернии. Так могли назвать выходца из Дунье. Оно может быть производной форой имени Даниил, которое в переводе с древнееврейского означает «бог - мой судья». Кроме того, имя Дунио может брать начало от арабского нарицательного «дуниа» со значением «мир, вселенная».