Фамилия Джахонгиров — одна из тех, что не встречается в старых русских переписных книгах, потому что её основа — восточное имя. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), эта фамилия ведёт происхождение от персидско-таджикского составного имени Джахонгир (Джахангир). В переводе с фарси оно означает «завоеватель мира» или «владыка вселенной»: «джахон» (мир, вселенная) + «гир» (берущий, захватывающий). Это имя было популярно в мусульманских династиях — самый известный носитель, падишах Империи Великих Моголов Джахангир (сын Акбара Великого), правил в начале XVII века.

Фамилия образована по русской патронимической модели: к основе Джахонгир добавлен русский суффикс -ов, который указывает на принадлежность («сын Джахонгира»). Такая модель типична для фамилий, которые возникли у народов, вошедших в состав Российской империи, особенно в Средней Азии и на Кавказе, где русская администрация фиксировала имена по отчеству с окончанием -ов или -ев. Поэтому Джахонгировы — это, скорее всего, потомки человека по имени Джахонгир, жившего в XIX — начале XX века, чьё имя записали в метрику или ревизскую сказку уже с русским окончанием.

Географически фамилия привязана к регионам, где говорят на таджикском, узбекском или близких к ним языках: Узбекистан, Таджикистан, а также южные области Кыргызстана и Казахстана. В России она встречается редко, в основном у выходцев из этих республик. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на последний слог — Джахонги́ров, хотя в устной речи возможны варианты.

Словообразовательно фамилия интересна тем, что в ней нет «среднеазиатского» суффикса -зода или -и (как в фамилиях Джахонгирзода, Джахонгири). Русский суффикс -ов — маркер того, что носитель или его предки жили в среде, где действовали имперские или советские правила записи фамилий. Это не делает фамилию «менее восточной» — просто её форма говорит о конкретном историческом контексте: о русификации имён при оформлении документов.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — например, Джахангиров (с буквой «а» в первом слоге) или Джаханширов, — то Джахонгиров тяготеет к таджикскому произношению, где «о» более открытое, чем в узбекском. Встречаются варианты написания с «а» (Джахангиров), но исходный корень один. Никакого отношения к русским словам «джаз» или «гиря» фамилия не имеет — это чисто ономастический случай, когда внешнее звучание обманчиво.