Фамилия Джаксбаев образована от имени Джаксыбай, которое состоит из двух компонентов: «жаксы» и «бай». В переводе с казахского языка «жаксы» означает «хороший, добрый человек», а слово «бай» в переводе с тюркского и казахского языков имеет значение «богатый (настоящий) человек». В прошлом термин «бай» использовался как титул богатых, властвующих людей. Возможно, давая своему сыну имя Джаксыбай, родители надеялись, что он станет добрым, богатым, уважаемым человеком. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, фамилия Джаксбаев восходит к названию киргизской реки Джаксы-бай, которая «берет начало в горном кряже Акчате, течет на юго-запад, прорезает озеро Сасык-куль и, не дойдя до реки Урала, теряется в песках». Возможно, основатель рода Джаксбаевых был родом из этих мест. Таким образом, потомок человека, которого звали Джаксыбай, со временем получил фамилию Джаксбаев.