Фамилия Джунгуров звучит необычно для русского уха, и это сразу подсказывает её вероятное происхождение. Она образована не от славянского корня, а от тюркского или кавказского прозвища, что подтверждается и суффиксом -ов, который в данном случае «обрусел» фамилию, подогнав её под стандартную русскую модель.

Основа фамилии — «Джунгур». Скорее всего, это искажённое или диалектное произношение слова «джунгар» (или «зюнгар»). В тюркских языках, особенно в казахском и киргизском, «джунгар» означало «воин» или относилось к названию крупного племенного объединения ойратов — Джунгарскому ханству. В истории Центральной Азии джунгары (калмыки) были известны как воинственные кочевники. Таким образом, первый носитель прозвища Джунгур мог быть выходцем из этих степей, либо получить такое прозвище за воинственный нрав, либо за внешнее сходство с представителями этого народа.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия отсылает к тюркскому слову «джунгур» — «звон», «журчание» (звукоподражательное). В этом случае прозвище мог получить говорливый человек или тот, кто жил у звонкого ручья. Однако связь с этнонимом «джунгар» выглядит гораздо убедительнее, учитывая распространённость подобных фамилий на юге России, в Поволжье и в Казахстане.

Словообразовательная модель проста: к основе «Джунгур» добавили русский патронимический суффикс -ов, что означает «сын Джунгура» или «принадлежащий роду Джунгуров». Фамилия редкая, её носители, скорее всего, имеют корни в среде калмыков, казахов или других тюркоязычных народов, но в силу исторических процессов (переселения, ассимиляция) фамилия закрепилась и в русскоязычной среде. Сословной принадлежности у фамилии нет — её могли носить и простые кочевники, и воины, и казаки.