Фамилия Егизарян — одна из тех, где за привычным окончанием скрывается сразу несколько версий происхождения, и ни одна не отпадает полностью. По армянской модели образования фамилий на -ян (в старой записи — -янц) она означает принадлежность к роду: «из рода Егизара». В основе лежит личное имя Егизар — армянская форма библейского имени Лазарь, которое восходит к древнееврейскому Элазар — «Бог помог». В Библии Лазарь из Вифании, брат Марфы и Марии, был воскрешён Иисусом на четвёртый день после смерти. По преданию, после воскресения он прожил ещё сорок лет и стал епископом Китиона на Кипре. Вполне вероятно, что основатель рода Егизарян был наречён в честь этого библейского героя.

Однако есть и другая, менее очевидная версия. Фамилию могли образовать от тюркского слова egizler — «близнецы». В этом случае прозвище Егизар мог получить один из близнецов, и оно закрепилось за родом. Третья версия, основанная на народной этимологии, разбивает имя на «его» (в значении «я») и «азар» («тысяча») — якобы так называли человека, любимого окружающими и собой. Эта гипотеза выглядит искусственной и не подтверждается ономастическими источниками; скорее всего, это позднее осмысление непонятного корня.

В истории рода есть документальный след. В 1753 году в Москву переехал видный армянский купец Егизар. Он построил под Москвой, в селе Фрянове, хлопчатобумажную и шелковую мануфактуры. Московские армяне, среди которых были и его потомки, участвовали в издании «Краткого исторического и географического описания царства Армянского» (1786) и первого самоучителя русского языка для армян (1788), составленного Клеопатрой Сарафовой. Так фамилия Егизарян, начавшись как указание на родство с конкретным человеком, оказалась связана с деловой и культурной жизнью армянской общины в России.