Фамилия Есенгельдина происходит от полного мужского имени Есенгельдин, которое в тюрко-мусульманской традиции собирали из трех смысловых блоков. Первый — казахское имя Есен, то есть «здоровый, благополучный». Второй — тюркский корень «кильде» или его варианты «гель», «гиль», означающие «родился» или «пусть родится». Третий — арабский компонент «дин» (вера, религия). Таким образом, имя Есенгельдин буквально складывается в пожелание: «пусть родится здоровым и верующим». Скорее всего, так назвали долгожданного сына, будущего основателя рода, в надежде, что он вырастет сильным мужчиной и истинным мусульманином.

Фамилия образована по русской модели: к основе Есенгельдин добавили суффикс -а, характерный для женского варианта фамилии. В исходной мужской форме фамилия звучит как Есенгельдин. Такая схема типична для регионов, где русское делопроизводство фиксировало тюркские имена и прозвища, присоединяя к ним фамильные окончания. Встречаются и однокоренные фамилии — Есенов, Есенгельдиев, Есенов, — но вариант с суффиксом -ин указывает на более раннее и прямое заимствование, без промежуточного отчества.

Географически фамилия Есенгельдина бытует в основном среди казахов и татар, особенно в западных и северных областях Казахстана, а также в Оренбургской и Астраханской областях России. Точное место и время возникновения рода без генеалогических изысканий не установить: процесс формирования фамилий у тюркских народов растянулся на несколько веков, и окончательные выводы требуют работы с архивными записями по конкретной семье.