Фамилия Есеркепова явно тюркского происхождения, и её основа — мужское имя Есеркеп (варианты: Есеркеп, Исеркеп). В казахском и других тюркских языках имя могло сложиться из двух частей: «ес» (память, разум, сознание) и «еркеп» (ласкаться, нежничать) или же из «есер» (влияние, воздействие) и «кеп» (образ, вид). Более правдоподобна версия, что имя Есеркеп — это народная форма арабского имени Исхак (Исаак), прошедшая через фонетические изменения в тюркской среде. Если так, то фамилия восходит к библейскому персонажу, но через мусульманскую традицию, где Исхак почитается как пророк.

Суффикс -ов(-а) — типичный для русской адаптации тюркских фамилий. В XIX–XX веках, при записи в метрики и паспорта, казахские и башкирские фамилии часто русифицировали, добавляя окончание -ов/-ев. Окончание -а указывает на женскую форму фамилии, но в современном русском языке оно закрепилось за женщинами, тогда как мужской вариант — Есеркепов.

Географически фамилия встречается преимущественно в Казахстане, особенно в западных и южных областях (Актюбинская, Кызылординская, Мангыстауская). Это указывает на родовые корни среди казахов Младшего жуза. В России носители фамилии редки, но встречаются среди казахов Оренбуржья и астраханских татар.

Словообразовательная модель проста: имя Есеркеп + русский патронимический суффикс -ов. Это значит, что предок носителя фамилии, скорее всего, был простым кочевником или скотоводом, а фамилию получил по имени отца или деда при переходе к оседлости и получении документов. Никакого дворянского или купеческого сословия за этой фамилией не стоит — она чисто народная, родовая.

Сравните с однокоренными фамилиями: Есергенов, Есеров. У них та же основа «ес» (разум), но разные суффиксы. Есеркепова отличается именно суффиксом -кеп, который встречается реже и придаёт имени уменьшительно-ласкательный оттенок. Это позволяет предположить, что имя Есеркеп когда-то было домашним, внутрисемейным прозвищем.