Фамилия Ешпатова — женская форма фамилии Ешпатов, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Ешпат. Слово это звучит не по-русски, и корни его, скорее всего, тюркские или финно-угорские. В русских фамилиях суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность: «чей?» — Ешпатов, то есть сын или потомок Ешпата.

Самая прямая версия — происхождение от марийского или удмуртского имени Ешпай (Эшпай). В этих языках «эш» или «ош» может означать «счастье», «удача», а «пай» — «доля», «часть». Имя Эшпай буквально переводится как «счастливая доля». Форма Ешпат могла возникнуть как адаптация на русской почве: звук «й» на конце заменили на более привычное «т», как это нередко бывало с иноязычными именами (сравните: Ахмат от Ахмад, Булат от Болат). В пользу этой версии говорит и география: фамилия Ешпатовы встречается в Поволжье, особенно в Марий Эл и соседних областях, где исторически жили марийцы.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским словом «еш» («друг», «товарищ») или «иш» («работа», «дело»). Тогда Ешпат могло быть прозвищем человека, известного как «друг» или «спутник», либо образовано от составного имени вроде Ишбат («крепкий в деле»). Однако для фамилии Ешпатов марийская этимология выглядит убедительнее, поскольку тюркские заимствования в этой форме в русских фамилиях редки.

Редкий суффикс -ат в основе (не путать с фамилиями на -атов, где «ат» часть корня) встречается в основном в фамилиях, адаптированных из неславянских языков. Ешпатовы — яркий пример того, как местное имя, пройдя через русское делопроизводство, закрепилось в фамилии. Сословно это могли быть государственные крестьяне или ясачные люди (платившие дань пушниной), а не дворяне — фамилия не фиксируется в родословных книгах. В советское время она распространилась шире, но до сих пор сохраняет региональную привязанность к Волго-Вятскому региону.