Фамилия Фахриддинов — одна из тех, что напрямую ведут в мусульманский мир и указывают на религиозное или почётное имя предка. В её основе лежит арабское составное имя Фахриддин (Фахр ад-Дин), которое переводится как «гордость веры» или «слава религии». Первая часть, «фахр», означает гордость, честь, славу; вторая — «дин» — веру, религию, судный день. Такие имена с компонентом «ад-Дин» были особенно популярны в исламской среде, их давали в честь уважаемых богословов, учёных или просто как благословение, желая мальчику стать опорой и украшением своей веры.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русского языка: к восточному имени Фахриддин добавили русский патронимический суффикс -ов. Это указывает на то, что фамилия формировалась уже на русской почве, скорее всего, в XIX–XX веках, когда у народов, исповедующих ислам и живущих в составе Российской империи или СССР, стали массово фиксировать фамилии по русскому образцу. Фахриддинов буквально означает «потомок (сын) Фахриддина». Если бы фамилия сохранила восточную модель, она звучала бы как ибн Фахриддин или Фахриддинзаде.

Географически фамилия распространена прежде всего среди татар, башкир, а также народов Северного Кавказа и Средней Азии, где ислам суннитского толка имеет глубокие корни. В России её чаще всего можно встретить в Татарстане, Башкортостане, в регионах с большим количеством татарских общин (например, в Оренбургской, Челябинской областях). Встречаются также варианты с усечением — Фахриддинов без двойного «д» на письме, хотя этимологически верно писать с двумя «д» (Фахриддин → Фахриддинов), так как в арабском написании «д» и «д» — разные буквы, но в русской транскрипции они часто сливаются.

Интересная деталь: фамилия Фахриддинов стоит в одном ряду с такими же «религиозными» фамилиями, как Нурутдинов («свет веры»), Сафиуллинов («чистота Аллаха»), Шамсутдинов («солнце веры»). Все они образованы от имён с корнем «дин» и суффиксом -ов, что делает их частью большой группы фамилий, которые в XX веке стали маркером татарской или башкирской идентичности. Носитель такой фамилии почти наверняка происходит из семьи, где в роду ценили религиозное образование и уважали духовных лиц — мулл или преподавателей медресе.