Фамилия Фалахеев — редкий случай, когда за основой не стоит ни крестильное имя, ни очевидное ремесло. Ее происхождение упирается в прозвище, а само прозвище — в слово, которое в разных говорах могло звучать по-разному. Скорее всего, в основе лежит «фалах» или «фалаха» — так в южнорусских и украинских диалектах называли неуклюжего, нерасторопного человека, увальня. Слово это, в свою очередь, восходит к тюркскому «фалах» — бедняк, горемыка, неудачник. Версия не единственная: в некоторых говорах «фалалей» означало простака, разиню, и фамилия могла возникнуть как фонетический вариант отчества от этого прозвища.

Суффикс -еев указывает на патронимическую модель: Фалахеев — буквально «сын Фалахея». Форма «Фалахей» — это русифицированный вариант прозвищного имени, которое в народной среде легко превращалось в Фалахей, а позже, при оформлении фамилии, дало характерное окончание. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от основ на твердый согласный, -еев здесь закрепился из-за мягкого звука [х’] в конце основы.

В дореволюционных переписях фамилия почти не встречается за пределами южных губерний — Курской, Воронежской, Области Войска Донского. Это подтверждает диалектную природу прозвища: там, где говорили «фалах», там и могли дать такую фамилию. В центральных и северных губерниях она не прижилась.

Если сравнить с однокоренными, то Фалалеев встречается чаще и понятнее по корню (от имени Фалалей, греческого Фалалей — «цветущая маслина»). Фалахеев же стоит особняком: его основа не календарная, а сугубо мирская, прозвищная. Это редкий пример, когда фамилия сохранила не церковное имя, а бытовую характеристику, причем с тюркским следом в диалекте.