Фамилия Фаридонов напрямую говорит о том, что её первый носитель был сыном человека по имени Фаридон. Это типичная русская модель образования фамилий от имени отца: к основе добавили притяжательный суффикс -ов, и получилось буквально «чей?» — Фаридонов, то есть наследник Фаридона.

Само имя Фаридон — это мусульманское мужское имя, которое восходит к арабскому корню со значением «бесподобный, не имеющий себе равных; единственный, особенный». Чаще упоминается близкая форма Фарид, а Фаридон — её вариант, который встречается в разных тюркских и иранских традициях. Встречается трактовка Фаридона как формы множественного числа от Фарида, что усиливает смысл: не просто единственный, а тот, кто выделяется среди многих.

Исторически фамилии с суффиксом -ов у мусульманских народов Поволжья, Кавказа и Средней Азии появлялись в XIX — начале XX века, когда началась русификация документов и переписей. Поэтому предки современных Фаридоновых, скорее всего, жили в татарской, башкирской или кавказской среде, а их имя при оформлении бумаг получило русское окончание.

Форма Фаридонов — довольно редкая. Чаще встречается упрощённая Фаридов или Фаритов, где основа обрезана. Сохранение полного имени Фаридон в фамилии — отличительная черта, которая указывает на то, что в семье имя отца произносили именно в этой полной форме и дорожили ею.