Фамилия Фаткулина происходит от арабского мужского имени Фатхулла, которое переводится как «победа принадлежит Аллаху». Это имя широко бытовало у народов, исповедующих ислам, особенно у татар и башкир, что напрямую указывает на географию возникновения фамилии — Поволжье и Приуралье.

История фамилии — это история фонетических изменений, которые прошло исходное имя. Первоначальная форма фатхуллинской фамилии, Фатхуллина, со временем упростилась: двойная «л» редуцировалась до одной, а звук «х» перешёл в более привычный для русского произношения «к». Так графический облик фамилии изменился, закрепившись в современном виде. Подобные трансформации — не редкость: при адаптации восточных имён русская речь часто смягчает гортанные звуки и устраняет удвоения.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: к основе, восходящей к имени, добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Фаткулина буквально означает «дочь (или жена) Фатхуллы». Мужской вариант — Фаткулин.

Процесс формирования таких фамилий у татар и других тюркских народов был длительным и завершился в основном к началу XX века. Поэтому точно определить, в каком конкретном селе и когда возник род Фаткулиных, можно только через глубокие генеалогические изыскания, обращение к метрическим книгам и ревизским сказкам. Сама же фамилия прочно связана с мусульманской традицией имянаречения, где имя давалось в честь божественных атрибутов, и несёт в себе пожелание покровительства высших сил.