Фамилия Фаткуллин — типичный пример того, как письменная форма слова расходится с её первоначальным звучанием. В основе фамилии лежит арабское мужское имя Фатхулла, которое означает «победа принадлежит Аллаху». Имя это составное: «фатх» — победа, и «Аллах» — имя Бога. Такие имена с религиозным смыслом были широко распространены у народов, исповедующих ислам, в первую очередь у татар и башкир, поэтому и фамилию Фаткуллин чаще всего относят к тюркско-мусульманской традиции.

Интересно, что современное написание — результат фонетических изменений. Первоначально фамилия звучала и писалась как Фатхуллин, где отчётливо слышна основа «Фатхулла». Со временем в живой речи звук «х» перед «у» редуцировался, превратившись в более простой для произношения «к», а двойное «л» сократилось до одного. Так графический облик фамилии упростился, но смысл, заложенный в имени, остался прежним.

Модель образования здесь классическая для русского языка: к восточному имени добавили русский патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность к отцу. То есть Фаткуллин буквально значит «сын Фаткуллы». Аналогичным образом построены фамилии Абдуллин, Гайнуллин, Хайруллин — все они происходят от составных арабских имён с компонентом «Аллах». Это позволяет говорить о целой группе родственных по происхождению фамилий, различающихся лишь первой частью имени.

Точное время возникновения фамилии установить сложно. Массовое закрепление фамилий у татар и башкир происходило в разное время, часто в XIX веке, после переписей населения. Однако отдельные роды могли получить фамилию и раньше, в среде духовенства или знати. Поэтому, чтобы узнать, когда именно и где появилась ветвь Фаткуллиных, нужны генеалогические изыскания: изучение метрических книг, ревизских сказок и архивных документов. Без них любые утверждения о конкретной дате останутся лишь предположениями.