Фамилия Фаткуллов напрямую связана с восточным мужским именем Фаткулла (в другом произношении — Фатхулла), которое переводится с арабского как «победа принадлежит Аллаху» или «победу дает Аллах». Имя составное: первая часть «фатх» означает «победа», «открытие», вторая — «Аллах». Такие имена с упоминанием божества были широко распространены у народов, исповедующих ислам, и несли сакральный смысл — родители вкладывали в имя пожелание божественного покровительства и успеха для ребенка.

Образование фамилии простое и типичное для тюркских и мусульманских народов России: к основе Фаткулла добавили русский патронимический суффикс -ов, который в данном случае выполняет функцию отчества. Буква «а» на конце имени выпала, и получилась форма «Фаткуллов». Такой способ русификации восточных имен массово применялся в XIX–XX веках при оформлении документов, когда представителям татар, башкир и других народов предписывалось фиксировать фамилии по русской модели.

Интересно, что в татарской среде долго сохранялась и форма без суффикса — просто Фаткулла, а также вариант Фатхуллин, где использован другой словообразовательный элемент. Фамилия Фаткуллов чаще встречается у татар и башкир, но нередка и у других народов Поволжья и Урала, где ислам имел распространение. Географически фамилия бытует преимущественно в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях — регионах, где исторически проживало тюркское население.

Ономастический анализ показывает, что фамилия относится к группе «именных» фамилий, то есть образованных непосредственно от личного имени без промежуточного прозвища или ремесленного обозначения. Это говорит о том, что первый носитель фамилии, скорее всего, был человеком, чье имя Фаткулла закрепилось за его потомками без дополнительных характеристик. В мусульманской традиции такие имена давали не по сословному признаку, а по религиозному обычаю, поэтому среди Фаткулловых могли быть и крестьяне, и торговцы, и духовные лица.

В написании фамилии встречаются колебания: наряду с Фаткуллов бытует вариант Фатхуллов и даже Фаткулов с одной «л». Двойная «л» в середине отражает арабскую геминацию (удвоение согласного) в оригинальном имени, хотя в разговорной речи она часто стягивается. При оформлении паспортов в советское время зачастую закрепляли упрощенный вариант, поэтому в разных ветвях одной семьи написание может различаться.

Отдельного внимания заслуживает семантика корня: «фатх» в арабском языке имеет также значение «открытие», «начало», и в религиозном контексте это слово связывали с победой веры. Поэтому имя Фаткулла иногда толкуют шире — как «открывающий врата милости Аллаха». Однако основной и наиболее признанный перевод остается прежним: «победа принадлежит Аллаху». Такое имя носили в честь значимых событий или в знак благодарности за долгожданного наследника.