Фамилия Фильченкова происходит от краткой формы Филя, которая в старину была одной из самых ходовых производных от церковного имени Филипп. Само имя пришло на Русь из греческого языка и переводится как «любитель лошадей», однако в крестьянской и посадской среде об этом значении давно забыли, и Филей называли просто любого Филиппа в обиходе, без всякой связи с конями.

Интереснее здесь не имя, а суффикс, который и отличает Фильченковых от многочисленных Филькиных, Фильшиных и Филиных. Формант -енк(о) в фамилиях указывает на украинское или южнорусское происхождение: такую модель активно использовали на Левобережной Украине, в Белгородчине и на Дону. Фильченко — это буквально «сын Фили», то есть потомок человека по имени Филя. А привычное для русского уха окончание -ова в Фильченковой — уже чисто грамматическое: так фамилию приспособили к женскому роду, когда стали говорить о жене или дочери Фильченко.

Стоит оговориться, что изначально Филя могло быть и не только сокращением от Филиппа. В некоторых говорах так звали и Филимона, и Филиппа без разбора, а в редких случаях прозвище Филя давали человеку с какой-то заметной чертой — например, простоватому или медлительному, хотя эта версия для фамилии менее вероятна. Основная масса Фильченковых всё же ведёт род от крещёного имени Филипп, которое в XVII–XVIII веках было очень распространено среди простых людей.

Фамилия эта довольно редкая в сравнении с Филатовыми или Филипповыми, потому что закрепилась она не в центральных русских землях, а ближе к южным рубежам, где прижилась украинская модель с -енко. В документах XIX века Фильченковы встречаются среди государственных крестьян и однодворцев Курской и Воронежской губерний — тех самых людей, которые несли пограничную службу и распахивали чернозёмные степи.

Если ваши предки носили эту фамилию, то почти наверняка они были выходцами из южнорусского или украинского села, где их пращура звали Филей. Фамилия не дворянская и не купеческая, а крестьянская, и в этом её тихая ценность: она сохранила живую народную форму имени, которая в официальных бумагах давно уступила место полному Филиппу.