Филя — уменьшительный вариант одного из греческих имён: Филипп, которое переводится как «любитель лошадей» или «наездник», или Филимон, что значит «верный, надёжный». Имя Филя было довольно распространено на Руси, поскольку имена Филипп и Филимон довольно часто встречались в святцах: в истории православия известно десять святых покровителей имени Филипп и пять — имени Филимон. Скорее всего, основатель рода Филиных был человеком из простого сословия.