Фамилия Филинович в первой своей части отсылает к прозвищу Филин, но у этого прозвища, как и у самой фамилии, несколько возможных историй, и разобраться в них стоит по порядку.

Самая прямая версия — прозвище по птице. Филином на Руси называли большую ушастую сову. Такое прозвище могло закрепиться за человеком, который не спал по ночам, бодрствовал, когда все отдыхали. В крестьянском быту, где день строился вокруг света и работы, ночная активность бросалась в глаза и быстро становилась поводом для меткого слова. Однако у восточных славян существовал и другой оттенок значения: филином или Филей в народе нередко называли простака, разиню, несообразительного человека. В этом случае прозвище несло бы уже не уважительный, а скорее насмешливый оттенок.

Отдельно стоит сказать об имени Филя. Оно не самостоятельное, а уменьшительная форма целого ряда крестильных имен: Филипп, Филимон, Филарет, Феофил, Памфил. Все они восходят к греческому корню phileo — «любить». Таким образом, Филинович может означать «сын Фила», то есть потомок человека, которого в обиходе звали Филей, независимо от того, какое полное имя он носил при крещении. Эта версия не менее убедительна, чем «птичья», а возможно, даже более жизненна: отчества от уменьшительных форм имен в русских фамилиях встречаются сплошь и рядом.

Есть и третья, менее вероятная гипотеза — связь с топонимом Филино. Деревни и села с таким названием были широко распространены по всей России: известны Филино в Даниловском районе Нижегородской области, в Ярославском районе Ярославской области, поселок в Приморском крае и другие. В этом случае основатель рода мог получить фамилию по месту жительства или рождения. Однако против этой версии говорит сам суффикс: фамилии, образованные от названий сел, чаще строятся через -ский (Филинский), тогда как -ович указывает на отчество, а не на географическую принадлежность.

Сама модель фамилии — с суффиксом -ович — характерна для белорусской, украинской и польской традиции, где она указывала на знатное или шляхетское происхождение, а позже распространилась шире. В русском северном и центральном обиходе такая форма встречалась реже, поэтому Филинович с большой долей вероятности имеет западнорусские или украинские корни, хотя прозвище Филин бытовало повсеместно. Со временем прозвище, изначально присоединенное к наследственному имени, полностью заменило его и в повседневной жизни, и в официальных документах, закрепившись в виде фамилии за потомками.