Фамилия Фильковский — один из тех случаев, когда за, казалось бы, простой формой скрывается долгая дорога от имени к фамилии. В её основе лежит церковное имя Филипп, которое пришло на Русь вместе с крещением. В переводе с древнегреческого оно означает «любитель лошадей» — так звали одного из апостолов, и имя это быстро прижилось в народной среде.

Однако напрямую от полной формы имени фамилию не образовали. В обиходе Филиппа чаще звали сокращённо — Филька. Именно эта разговорная, «домашняя» форма и стала отправной точкой. От неё пошло множество однокоренных фамилий: Филин, Филькин, Фильков, Филимонов. Фильковские выделяются на их фоне своим суффиксом -ский, который указывает на иную модель образования.

Суффикс -ский в русской ономастике чаще всего связан с польско-украинской традицией или с фамилиями, которые получали дворяне по названию своих владений. Но для крестьянской и мещанской среды этот суффикс мог означать не принадлежность к земле, а просто «выходец из семьи Фильки» или «сын Фильки». Скорее всего, основатель рода Фильковских был человеком простого звания — ремесленником или крестьянином, а его потомки, переезжая в города, закрепили за собой эту форму как более «благородную» по звучанию.

Точное место и время появления фамилии назвать трудно. Процесс закрепления фамилий растянулся на несколько столетий: где-то они оформились уже в XVI веке, а где-то — только к концу XIX. Форма Фильковский встречается и в польских землях, где суффикс -ский был нормой для шляхты, и в белорусских, и в русских губерниях. Это говорит о том, что носители фамилии могли мигрировать, а сама фамилия — возникать в разных местах независимо.

Несмотря на кажущуюся простоту, Фильковские — это живой памятник славянской письменности. В ней соединились церковная книжность (имя Филипп) и народная языковая стихия (Филька), а дворянский по звучанию суффикс придал фамилии ту форму, которую мы знаем сегодня.