Фамилия Фильков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Фильков послужило церковное имя Филипп. Фамилия Фильков восходит к церковному мужскому имени Филипп, которое в переводе с древнегреческого означает «любитель лошадей». Это имя имеет ряд производных разговорных форм, одна из которых — Филя — и легла в основу данной фамилии. Сама по себе фамилия Фильков является отчеством второго порядка: Фильков — сын Филько, внук Фили. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Филя, со временем получил фамилию Фильков. О точном месте и времени возникновения фамилии Фильков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Фильков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.