Фамилия Филюхин — яркий пример того, как уменьшительно-ласкательная форма имени становится основой для родового прозвища. В её основе лежит имя Филя — народная, сокращённая версия одного из крестильных имён: Филипп (с греч. «любящий коней»), Филарет («любящий добродетель») или Филофей («боголюбивый»). В быту Филей называли не только ребёнка, но и взрослого человека, а затем и его потомков. Модель образования проста: к основе «Филюх-» (где «-юх-» — суффикс субъективной оценки, придающий именованию фамильярный или ласкательный оттенок) добавился типичный русский суффикс принадлежности «-ин». Таким образом, Филюхин буквально означает «сын Филюхи», то есть потомок человека, которого в обиходе звали Филюхой.

Интересно, что суффикс «-юх-» в русских фамилиях встречается реже, чем «-к-» (Филькин) или «-ш-» (Филин). Это делает Филюхина несколько более редким вариантом по сравнению с однокоренными Филькиным или Филиным. Такие формы часто закреплялись в среде, где имя употребляли скорее как прозвище, чем как официальное обращение — в крестьянских и мещанских семьях, где полные имена могли звучать слишком торжественно.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям. Встречается она и на Урале, что указывает на миграцию крестьян в XVIII-XIX веках. Социальный контекст здесь прозрачен: Филюхины — это потомки свободных земледельцев или дворовых людей, получивших фамилию по деду или отцу, которого в деревне знали как Филюху. Никакого отношения к знатным родам или дворянству эта фамилия не имеет — её происхождение чисто народное, бытовое.

Если разбирать этимологию глубже, то стоит отбросить соблазн связать фамилию с современным словом «филя» (простак, разиня). В XVI-XVII веках такого значения у имени Филя не было — это была нейтральная форма, как сегодня Ваня или Петя. Пренебрежительный оттенок появился позже, уже в литературном языке XIX века, и к происхождению фамилии отношения не имеет. Так что предки носителя фамилии Филюхин были, скорее всего, обычными людьми, которых звали по имени, а не по насмешливому прозвищу.