Фамилия Филюнов — классический пример русской «патронимической» фамилии, то есть образованной от личного имени или прозвища отца. Если коротко: в её основе лежит простонародная форма канонического имени Филипп — Филюн. Само имя Филипп пришло на Русь из греческого языка и переводится как «любитель лошадей». Именно от этой разговорной формы, а не от полного церковного имени, и пошли Филюновы.

Словообразовательная модель здесь простая и очень распространённая: к основе Филюн добавили типичный русский суффикс принадлежности -ов, который отвечал на вопрос «чей?». Таким образом, Филюнов буквально означает «сын Филюна», «ребёнок того, кого звали Филюном». Такая схема (усечение имени + суффикс -ов/-ев) в XV–XVII веках была главным способом закрепить за семьёй родовое прозвание, и Филюновы — лишь один из многих примеров этого процесса.

Существует и вторая, менее правдоподобная версия происхождения. Она возводит фамилию не к имени, а к прозвищу Филюн, которое связывают с нарицательным словом «филя». В некоторых говорах «филей» называли простака, разиню или простофилю. Однако эта гипотеза выглядит слабее: слишком уж очевидна связь Филюна с Филиппом, а прозвища, как правило, не имели такой устойчивой именной формы. Скорее всего, мы имеем дело именно с народной формой крестильного имени, которая в старину была обычным делом — вспомним хотя бы Степан от Стефана или Аксён от Авксентия.

Интересно, что фамилия Филюнов не одинока. У неё есть целый «куст» родственных фамилий, образованных от тех же уменьшительных форм имени Филипп: Филюшин, Филькин, Филонов, Филин. Все они — следы одного корня, просто в разных местностях и в разное время народная фантазия выбирала разные ласкательные или обиходные варианты одного и того же имени.

Точное место и время возникновения фамилии Филюнов назвать сложно — фамилии формировались постепенно и в разных регионах не одновременно. Но если судить по модели, пик распространения таких «сыновьих» фамилий пришёлся на XVI–XVII века, когда окончательно складывался русский фамильный тип. Сегодня Филюновы встречаются в разных областях России, но чаще всего — в центральных и поволжских регионах, что косвенно подтверждает давнюю историю фамилии в этих землях.

Несмотря на обилие версий, суть одна: Филюновы — потомки человека по имени Филюн, а значит, их родословная уходит корнями в ту эпоху, когда имя было не просто ярлыком, а личным оберегом и семейной памятью.