Фамилия Фокинова — женская форма фамилии Фокинов, а та, в свою очередь, образована от имени Фока. Казалось бы, всё просто, но здесь есть тонкость, которая отличает эту фамилию от более распространённой Фокин.

Фока — это древнегреческое имя (Phokas), означавшее «тюлень» или «морской котик». В христианском календаре известно несколько святых с этим именем, самый почитаемый — священномученик Фока, епископ Синопский. Имя было распространено в среде духовенства и среди крестьян, особенно в северных и центральных губерниях России.

Отличие Фокинова от Фокина — в суффиксе. Фамилия Фокин образована напрямую от имени Фока с помощью стандартного суффикса -ин: «чей?» — «Фокин сын». А Фокинов — это вторичная форма, патроним от патронима. Сначала появилось отчество Фокинович (или Фокинов сын), то есть «внук Фоки», а уж от него закрепилась фамилия Фокинов. Такая модель встречается реже и говорит о том, что фамилия могла сложиться позже, когда отчества уже стали трёхчленными, или в среде, где было важно подчеркнуть принадлежность к целому роду, а не только к отцу.

Словообразовательная цепочка выглядит так: Фока → Фокин (сын) → Фокинов (внук). Фокинова — это «внучка Фоки» или «жена Фокинова». Встречается такая фамилия в основном в центральных областях России, в документах переписи XIX века она фиксируется, например, в Тамбовской и Рязанской губерниях. В отличие от массовой фамилии Фокин, Фокинова — вариант заметно более редкий, что делает её носителей обладателями менее типового, а значит, более выделяющегося родового имени.