Фамилия Фолюш — редкая, и её разговорный, почти прозвищный облик сразу наталкивает на мысль о польском или западнорусском происхождении. В русском языке суффикс -уш (-юш) обычно образует ласкательные или уменьшительные формы имён: Иван — Ванюш, Павел — Павлюш. Фолюш, скорее всего, пошёл от той же модели, только основа здесь нестандартная.

Самая вероятная версия — связь с польским словом «fala» (волна) или «falować» (волноваться). В таком случае Фолюш — это уменьшительное от прозвища Фаля, которое могли дать человеку за кудрявые волосы, напоминающие волны, или за неспокойный, переменчивый нрав. Корень «fal-» в польских фамилиях встречается (Фаля, Фалевский), но форма Фолюш — более редкая, народная, почти деревенская по звучанию.

Другая, менее вероятная гипотеза выводит фамилию от имени Аполлинарий (в просторечии — Фоля, Фолюш). Аполлинарий — имя греческого происхождения, означающее «посвящённый Аполлону». В польской и украинской традициях его часто укорачивали до Фолька или Фолюша. Но учитывая, что полная форма имени в крестьянской среде была редкостью, этот путь кажется более книжным, чем реальный бытовой.

Географически фамилия тяготеет к западным областям бывшей Речи Посполитой — современной Западной Украине, Беларуси и восточной Польше. Там уменьшительные формы на -уш особенно распространены. В России Фолюш — большая редкость, носители встречаются единично, что подтверждает её локальный, возможно, даже микродиалектный характер.

В словообразовательном плане фамилия не получила типичного русского суффикса -ов или -ин, что указывает на её позднюю фиксацию или на то, что она закрепилась в форме чистого прозвища, без адаптации под великорусскую модель. Это делает её ценной для ономастов: она сохранила исходный, «живой» вид, не переработанный канцелярией XIX века.