Фамилия Фоменеко — яркий пример украинской модели фамилии, образованной по той же схеме, что и более привычное «Фоменко», но с заметной диалектной или орфографической особенностью. В основе лежит каноническое имя Фома (от арамейского «близнец»), а суффикс «-енко» указывает на «маленького», «сына» или «потомка» человека с этим именем. То есть Фоменеко — буквально «сын Фомы» или «Фомин сын». Это типичная патронимическая модель, которая в XVI–XVIII веках закрепилась на территории Левобережной Украины, особенно в казацкой среде, и со временем стала самой распространённой украинской фамильной формой.

Отличие от привычного «Фоменко» — в ударении и написании. Вариант Фоменеко (с ударением на «е») встречается реже и может отражать местный говор: в некоторых украинских диалектах гласный после «м» звучал более открыто, что и закрепилось на письме. Также нельзя исключать, что это результат поздней русификации или ошибки при записи в метрических книгах — на слух «Фоменко» и «Фоменеко» в быстрой речи почти неразличимы, а писцы могли фиксировать как слышали.

По географии фамилия Фоменеко рассредоточена неравномерно. Если «Фоменко» — одна из самых частых украинских фамилий (входит в первую десятку по распространённости), то вариант с «е» тяготеет к южным и центральным областям Украины, а также к регионам, куда в XIX–XX веках переселялись украинские крестьяне — Кубань, Ставрополье, Донбасс. В России носители Фоменеко встречаются в основном в Краснодарском крае и Ростовской области.

Социальный состав предков — преимущественно крестьянство и казачество. Фамилии на «-енко» в XVII–XVIII веках были маркером свободного сословия: их носили реестровые казаки, мещане и селяне, в отличие от польских или русских дворянских фамилий на «-ский». Никакого отношения к знатному роду или духовенству эта модель не имела — Фоменеко почти наверняка происходит от простого человека по имени Фома, который жил в украинском селе три-четыре века назад.

Не стоит путать фамилию с ошибочным написанием «Фоминеко» — такого варианта в исторических источниках практически нет, а вот «Фоменеко» фиксируется в ревизских сказках XIX века, например, в Полтавской и Харьковской губерниях. Если ваша фамилия записана именно так, это может говорить о том, что предки происходили из местности, где «еканье» было нормой, либо что документы оформлял малограмотный писарь, не знакомый с литературной нормой.