Фамилия Фомская — женская форма, мужской вариант — Фомский. На слух она воспринимается как типичная «дворянская»: суффикс -ск- указывает на принадлежность к местности или владению. В русской ономастике фамилии на -ский/-ской действительно чаще возникали в среде шляхты, духовенства и образованных слоёв, но встречались и у крестьян, переселившихся из другого села.

Основа фамилии — Фома. Это каноническое крестильное имя, пришедшее из древнееврейского (תאום — «близнец»). В русских говорах имя обросло множеством производных: Фомка, Фомушка, Фомин, Фомичёв. Но Фомский — не патроним (не «сын Фомы»), а топонимическая или посессивная форма. То есть Фомский — тот, кто родом из места, названного в честь Фомы: деревни Фомки, Фомово, Фоминское. Таких селений в России десятки, особенно в центральных и северных губерниях. Фомская, соответственно, означает «из рода Фомских» или «уроженка такого-то села».

Интересная деталь: фамилия Фомский могла закрепиться за учениками духовных семинарий. Семинаристам часто давали фамилии по именам святых, причём в облагороженной форме на -ский. Фома — апостол, поэтому Фомский звучало более книжно и возвышенно, чем просто Фомин. Если предок носителя фамилии учился в семинарии, фамилия могла быть искусственно образована от имени святого прямо при поступлении.

Встречается Фомская и как вариант отчества от прозвища Фома — в тех случаях, когда фамилию давали не по отцу, а по прозвищу главы семьи, но с топонимическим суффиксом. Такое смешение моделей характерно для западных регионов бывшей Речи Посполитой, где -ский было универсальным маркером фамилии. В современной России фамилия редкая, сосредоточена в основном в Центральном и Северо-Западном округах, что подтверждает её севернорусские или псковско-новгородские корни.