Фамилия Фомко — яркий пример того, как в русской ономастике работает украинская и белорусская модель образования. Если в России от имени Фома чаще всего делали фамилии с суффиксом -ов (Фомин, Фоминцев), то на западнорусских землях закрепился суффикс -ко. Он выполнял роль уменьшительно-ласкательного или, точнее, «сыновьего» показателя: Фомко — это буквально «маленький Фома» или «сын Фомы». Такая модель была особенно популярна в XVI–XVII веках на территории современной Украины и юга Беларуси, откуда фамилия и распространилась дальше.

Само имя Фома — это русская форма арамейского имени Феома (תאומא), что значит «близнец». В христианской традиции это имя носил один из двенадцати апостолов, известный как Фома Неверующий. В народной среде имя было очень распространённым, поэтому неудивительно, что от него возникло множество производных форм и фамилий. Фомко — одна из таких обиходных, «домашних» форм, которая со временем закрепилась как наследственная.

Интересно, что фамилия Фомко встречается не только у славян. В некоторых случаях она могла быть искусственно создана или адаптирована при переписях населения из других, похоже звучащих прозвищ. Например, в польском языке есть слово «fomka» (воронка, лейка) или диалектное «fomko» — так могли назвать человека с определёнными чертами характера или внешности. Но это версия менее вероятная, чем основная — от имени Фома.

Географически фамилия наиболее плотно представлена в западных областях России (Брянская, Смоленская, Псковская), а также в Беларуси и на востоке Украины. Встречается она и у потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке, куда в XIX веке уезжали крестьяне в поисках земли. Сословно носители фамилии Фомко в подавляющем большинстве были крестьянами или мещанами — дворянских родов с такой фамилией практически не зафиксировано.

В отличие от фамилий Фомин или Фоминцев, которые говорят о принадлежности к отцу (Фомин сын), Фомко сразу указывает на то, что предка звали именно в уменьшительной, бытовой форме. Это типичная «уличная» или «деревенская» фамилия, которая закрепилась в эпоху, когда люди ещё не имели официальных фамилий, а называли друг друга по имени с оттенком родства или близости.