Доля фамилий греческого происхождения велика на территориях сопредельных с Грецией государств, на Кавказе и в Закавказье, а также в Румынии, Молдавии, на Украине, в России и Казахстане. Фамилия Фондомакин, предположеитльно, представляет собой вариант фамилии Фондомакис, адаптированной славянами. В свою очередь, фамилия Фондомакис образована от аналогичного прозвища. Оно представляет собой сочетание греческой основы «фонт» со значением «голос» и имени Макис. Это имя является производной формой имени Кузьма, которое в переводе с греческого означает «мироздание, космос». Таким образом, именование Мондомакис можно трактовать как «голосистый Макис». Скорее всего, это прозвище получил человек по имени Макис, который имел громкий голос. Возможно также, что фамилия Фондомакис происходит от прозвище Фондомак. Оно может восходить к турецкому нарицательному fonda – «якорная стоянка». Компонент –мак также имеет турецкое происхождение. Таким образом, именование Фондомак может означать «тот, кто имеет отношение к якорной стоянке». Можно предположить, что Фондомаком назвали работника причала. Таким образом, потомок человека, которого звали Фондомакис, со временем получил фамилию Фондомакин.