Фамилия Фондомакина — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного славянского суффикса -ов или -ин, что сразу наводит на мысль: перед нами не типичная русская фамилия, а скорее адаптированная к русскому языку иноязычная основа. Скорее всего, она образована от мужской формы Фондомакин, а та, в свою очередь, — от прозвища или имени Фондомака.

Корень «фонд» здесь обманчив. В русском языке слово «фонд» (от лат. fundus — основание) закрепилось в XVIII–XIX веках, но для фамилии оно маловероятно: прозвища от абстрактных понятий такого рода — редкость. Гораздо правдоподобнее, что «Фондо» — это искажённая запись греческого или румынского имени. Например, в греческом есть имя Фотиос (от «фос» — свет), которое могло в народном произношении превратиться в «Фондо». Вторая часть — «мака» — может восходить к греческому «макариос» (счастливый, блаженный) или к румынскому слову со значением «маленький». Таким образом, Фондомака — это сложное имя-прозвище, что-то вроде «светлый счастливчик» или «маленький Фотис».

География фамилии тоже подсказывает ответ. Фондомакины — это почти наверняка выходцы из южнорусских регионов, особенно с Кубани и из бывшей Таврической губернии, где исторически сложились крупные общины греков и румын (молдаван). Фамилия могла закрепиться за переселенцами, которые принесли её с Балкан или из Причерноморья. Русские писцы, записывая незнакомое имя на слух, прибавили к нему типичный малороссийский суффикс -ин (а не -ов), что указывает на женскую линию или на то, что основа прозвища оканчивалась на -а.

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» или в «Общем гербовнике» не значится. Если искать параллели, то однокоренными можно считать фамилии Фондамин, Фондаков — все они редки и тяготеют к югу России. Таким образом, Фондомакина — это не загадочный «финансовый» корень, а живая память о греческом или молдавском предке, чьё имя было переделано на русский лад.