Фамилия Францифоров — редкий случай в русском ономастиконе, где за привычным суффиксом -ов скрывается не славянская, а латинская основа. Вопреки возможному предположению, она не связана с французами напрямую. Её ядро — католическое имя Франциск, которое в русской народной передаче нередко упрощалось и искажалось. Форма «Францифор» — это один из вариантов бытового произношения имени Франциск или его производных (Франц, Франтишек, Франческо). В документах XVII–XVIII веков, особенно в западных и южных губерниях Российской империи, можно встретить записи вроде «Францыфор», «Францифор», «Францфор» — так записывали в православные метрики людей, крещённых в католической традиции или носивших польское, белорусское, украинское имя.

Суффикс -ов указывает на типичную модель образования русских фамилий от прозвищ или имён: Францифоров — буквально «сын Францифора», «принадлежащий Францифору». По сути, это патроним, застывший в третьем поколении. Интересно, что в отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Петров, Францифоров почти не встречается в центральных великорусских губерниях. Основной ареал — бывшие территории Речи Посполитой: Смоленщина, запад Брянщины, Псковская область, а также переселенческие потоки на Урал и в Сибирь. По данным переписей XIX века, носители фамилии часто были государственными крестьянами или однодворцами — потомками служилых людей, которые несли сторожевую службу на южных и западных рубежах.

Есть и вторая, менее вероятная версия: от прозвища Францифор, которое могло возникнуть в среде духовенства или семинаристов. В духовных училищах XVIII–XIX веков было принято «латинизировать» фамилии, давая ученикам звучные имена святых. Однако в случае с Францифоровым это сомнительно: семинаристы чаще получали фамилии на -ский (Францисковский, Францисский), а не на -ов. Так что бытовое, народное происхождение — от реального имени или уличного прозвища — выглядит убедительнее.

В современной России фамилия остаётся малочисленной. По данным открытых телефонных справочников и баз ЗАГС, основные очаги — Пермский край, Челябинская область и Алтайский край, куда в XIX веке переселялись крестьяне из западных губерний. Встречается также вариант Францыфоров — с буквой «ы» в корне, что отражает местное произношение («францы» как «французы»). В любом случае, Францифоров — это фамилия-след, указывающая на контакт двух культур: западнославянской (католической) и восточнославянской (православной), где чужое имя перекроили на свой лад и дали ему русский суффикс.