Фамилия Фыгин — редкая и нестандартная для русского уха. Её основа сразу настораживает: сочетание «фы» нетипично для исконно русских слов, которые избегают звука «ф» в начале корня. В древнерусском языке «ф» встречалась почти исключительно в заимствованиях, поэтому первая версия происхождения — иноязычная.

Скорее всего, Фыгин — это русифицированная форма еврейской фамилии Файгин или Фигин. Исходная основа — женское имя Фейга (идиш פֿײגע, от немецкого Feige — «фига», «смоква»). В еврейской традиции это имя было популярным, а фамилия Файгин (с суффиксом -ин) означала «сын (потомок) Фейги». При переходе в русскую среду произношение могло измениться: «ай» перешло в «ы» (как в случае с фамилией Лыткин от Лайтка), и появился необычный вариант Фыгин.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная в южнорусских говорах: связь с диалектным словом «фыга» — вариант «фига» (кукиш, дуля). В таком случае прозвище Фыга могли дать человеку с насмешливым или упрямым характером, который часто показывал кукиш. Однако письменные источники фиксируют фамилию Фыгин в основном в черте оседлости и среди еврейского населения, что подтверждает первую гипотезу.

Суффикс -ин в фамилии Фыгин указывает на принадлежность: «чей?» — Фыгин, то есть «сын Фыги». Это типичная модель для русских фамилий, но применительно к иноязычной основе. Встречаются также варианты написания Фыгина (женская форма) и Фыгины (множественное число), но сама фамилия остаётся редкой. В современных базах данных она единична, что делает её особенно интересной для потомков, пытающихся восстановить семейную историю.