Фамилия Габдрафитова — женская форма, а её мужской вариант Габдрафитов. Это типичная фамилия тюркского происхождения, образованная по арабской модели. Если коротко: она говорит о религиозной традиции в семье предков.

Корень фамилии — арабское имя Габдрафик (или Абдрафик), где первая часть «габд» (или «абд») переводится как «раб», а вторая «рафик» — «милосердный», «добрый». Полное значение — «раб Милосердного». Это одно из многих имён, которые мусульманские народы образовали от эпитетов Аллаха (в данном случае от «Ар-Рафик»). Имя Габдрафик (Абдрафик) бытовало у татар, башкир и других народов Поволжья и Урала.

Фамилию строили по обычной для этих регионов схеме: к имени отца добавляли русский патронимический суффикс -ов (или -ев). Сын Габдрафика становился Габдрафитовым. В метрических книгах и ревизских сказках XIX века такие фамилии встречаются в основном среди татарских и башкирских крестьян, а также среди мусульманских купцов и духовенства. Сословной границы тут не было — имя-основа религиозное, а суффикс общерусский.

Интересная деталь: написание через начальное «Г» (Габдрафитов) — характерная особенность татарской и башкирской передачи арабского имени. В русской среде чаще встречается вариант Абдрафитов, где первый звук редуцировался. Если ваша фамилия пишется именно через «Г», это указывает на сильное влияние местного произношения: в тюркских языках начальный гортанный смычка передаётся твёрже.

Сравните с однокоренными фамилиями: Габдуллин (от Габдулла), Габбасов (от Габбас), Абдрахманов — все они построены по одному принципу, но с разными именами-основами. Фамилия Габдрафитова стоит в ряду тех, что прямо указывают на исламскую традицию именования, и её носители — потомки людей, носивших имя, прославляющее одно из качеств Бога.