Фамилия Габдулханов — яркий образец тюрко-татарской антропонимии, где за основу взято арабское по происхождению имя. Она образована по классической для русского языка модели: к основе, которая является именем собственным, добавляется суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Габдулхана). Ударение, скорее всего, падает на последний слог: Габдулха́нов.

Корень фамилии — сложное составное имя Габдулхан (или Абдулхан). Первая часть «Габдул» (от араб. Абдул) означает «раб», «слуга», но в контексте теофорных имен — «раб (Божий)». Вторая часть «хан» — тюркский титул, обозначающий правителя, владыку. В мусульманской ономастике «хан» часто включается в состав имени как почетный компонент, не обязательно указывающий на реальное происхождение от ханского рода. Таким образом, имя Габдулхан осмысляется как «раб Владыки» (то есть Бога), что является калькой с арабского Абдул-Малик (Малик — «владыка»). Имя подчеркивает религиозное смирение перед Всевышним, но с использованием привычного для тюркской среды титула.

С точки зрения географии, фамилия Габдулханов наиболее распространена среди татар и башкир, а также встречается у народов Северного Кавказа (например, у кумыков и ногайцев), где также сильны тюркские и исламские традиции. Встречаются варианты написания: через «А» — Абдулханов, что является фонетически более близким к арабскому источнику. Форма «Габдулханов» характерна для татарского произношения, где начальный «а» под влиянием гортанного звука переходит в «га» (так называемое «га-канье»).

Предки носителя фамилии, скорее всего, были мусульманами, возможно, из духовного сословия или зажиточных крестьян-земледельцев, так как имя Габдулхан считалось «книжным», религиозным, и его давали в семьях, дороживших грамотностью и традицией. В сословном плане фамилия не указывает на дворянство: в Российской империи татарские и башкирские фамилии на -ов/-ев массово фиксировались у всех слоев населения после ревизий и переписей XIX века, поэтому Габдулхановы могли быть как муллами, так и простыми ясачными крестьянами.