Фамилия Габрусев — редкий случай, когда географическая привязка проясняет происхождение лучше, чем морфологический разбор. Суффикс -ев указывает на русскую модель образования от отчества или прозвища, но основа выдает западнославянские или балтийские корни. Скорее всего, перед нами белорусская или польская фамилия, адаптированная на русской почве.

В основе лежит имя Габрусь — народная форма канонического имени Гавриил (в белорусском языке звучит как Габрусь). Суффикс -ев присоединили по русской модели: Габрусев значит «сын Габруся». В польском языке аналогом было бы имя Gabriel, уменьшительное Gabryś, но белорусский вариант с ударением на первый слог и твердым «р» ближе к фамилии Габрусев. Встречается также вариант Габрусевич, который сохраняет белорусскую патронимическую форму.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с литовским словом «gabrus» — «проворный, быстрый». В приграничных с Литвой районах Беларуси такие заимствования встречаются, но имя Габрусь как производное от Гавриила распространено шире. Словарь Б. Унбегауна относит подобные фамилии к группе патронимов от уменьшительных форм христианских имен, что подтверждает первую гипотезу.

Носители фамилии Габрусев исторически концентрировались на территории бывшего Великого княжества Литовского — в Минской, Витебской и Гродненской губерниях. В XIX веке, после отмены крепостного права, часть крестьянских семей с этой фамилией переселилась в Сибирь и на Урал. Сословная принадлежность преимущественно крестьянская или мещанская, дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не зафиксировано.

Ударение в фамилии — на второй слог: Габру́сев. В разговорной речи иногда смещают на первый, что указывает на белорусское произношение исходного имени.