Фамилия Габрусская — одна из тех, чья история начинается не с имени, а с прозвища или географического названия. Её основа, «Габрус», с большой вероятностью восходит к диалектному слову «габрус» — так в некоторых западных и южных говорах называли горбуна, сутулого человека. В этом случае прозвище Габрус давали человеку с характерной осанкой, и оно стало родовым именем для его потомков. Суффикс -ск- указывает на типичную модель образования фамилий у польской, белорусской и украинской шляхты, а также у духовенства. В сочетании с окончанием -ая (Габрусская) это говорит о том, что фамилия, скорее всего, сформировалась на территории, где были сильны польские или западнорусские ономастические традиции.

Существует и альтернативная версия, которую нельзя сбрасывать со счетов: фамилия могла произойти от названия населённого пункта вроде Габрусы или Габрусево. Такие топонимы встречаются в Беларуси и на западе России. В этом случае первый носитель фамилии был либо выходцем из этой местности, либо владельцем земли («Габрусский» — тот, кто родом из Габрусов). Проверить эту гипотезу можно через старые карты и ревизские сказки — если удастся найти деревню с таким корнем, версия станет основной.

В отличие от массовых фамилий на -ов и -ин, Габрусская — относительно редкая. Её носители, скорее всего, были либо мелкими дворянами (шляхтой), либо крестьянами, получившими фамилию по месту жительства. В любом случае, корень «габр» — не русский, а скорее западнославянский или балтский, что указывает на географию происхождения: современные Беларусь, Польша, Литва или Смоленщина. Сравните с однокоренными фамилиями Габрусь, Габрусевич — они распространены именно в этих регионах.