Фамилия Габсаликов — редкая и географически привязанная. Её основа — тюркское или арабо-тюркское имя Габсали (вариант: Гапсали, Габсалям). В нём угадывается корень «габд» (араб. عبد — «раб», в составе имён «раб Всевышнего») и вторая часть, восходящая к имени Салих (праведный) или к слову «салям» (мир). Таким образом, полное значение — «раб Праведного» или «раб Мира», типичное для мусульманских имён, распространённых у татар, башкир и народов Кавказа.

Суффикс -ов указывает на русскую модель оформления фамилии, характерную для крещёных татар или народов, вошедших в состав Российской империи. Носители фамилии Габсаликов — это, скорее всего, потомки человека по имени Габсали, жившего в среде, где имена давали по исламской традиции, а фамилии записывали по русскому образцу. Встречается фамилия в основном в Татарстане, Башкортостане и Оренбургской области — зонах исторического расселения татар и башкир.

Интересная деталь: написание «Габсаликов» с буквой «к» на конце (а не «Габсалиев») говорит о том, что исходное имя имело твёрдую конечную согласную — вероятно, Габсалик или Габсалык. Это мог быть местный диалектный вариант или уменьшительная форма. В тюркских языках суффикс -лык/-лик образует прилагательные и существительные (например, «башлык» — головной убор), так что Габсалик могло означать «принадлежащий к роду Габсали», «относящийся к Габсали». Русский суффикс -ов добавил окончание, и получилась фамилия «из рода Габсалика».

По сословной принадлежности предки Габсаликовых, скорее всего, были государственными крестьянами или служилыми татарами — не дворянами, но и не крепостными. В метрических книгах XIX века фамилия встречается в записях о рождении в деревнях Казанской и Уфимской губерний. Известных носителей с общероссийской славой нет, что делает фамилию характерной для локальной родовой памяти.