Фамилия Гадоев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её звучание может навести на мысль о тюркских или иранских корнях, и это предположение близко к истине, но с оговорками.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с персидским или таджикским словом «гадо» (گدا), что означает «нищий», «попрошайка» или «бедняк». В дореволюционной Средней Азии такое прозвище мог получить человек, занимавшийся сбором подаяния, либо тот, кого в шутку или с укором называли бедняком. Суффикс -ев указывает на русскую модель патронимического образования: Гадоев — буквально «сын Гадо» или «потомок того, кого звали Гадо». Фамилия могла возникнуть у таджиков, узбеков или представителей других народов, попавших в сферу русского делопроизводства, где фамилии оформляли по стандартному шаблону.

Вторая, менее распространённая гипотеза — связь с арабским именем «Гади» (или «Гадий»), которое встречается в мусульманских семьях. В таком случае фамилия образована от имени, а не от прозвища. Однако форма «Гадоев» (с буквой «о» в корне) типична именно для тюркской и иранской адаптации, где «Гадо» — самостоятельное прозвище или уменьшительная форма.

Не стоит путать эту фамилию с похожей по звучанию осетинской фамилией Гадиев (от имени Гади). Гадоев — иная модель, и её носители чаще всего встречаются в Таджикистане, Узбекистане, а также среди выходцев из этих регионов в России. В русском языке фамилия не имеет ничего общего с негативной коннотацией, которую могло нести исходное слово, — она лишь отражает социальный или бытовой контекст, в котором жили предки.