Фамилия Гакис — редкий пример, где греческое происхождение почти не вызывает споров. В отличие от большинства русских фамилий на -ис, которые могли возникнуть из родительного падежа славянских прозвищ (типа «у Галки» — Галкис), Гакис прямо указывает на греческие корни. В греческом языке суффикс -ис характерен для фамилий, образованных от личных имён или прозвищ. Основа «Гак-» восходит к греческому слову γάκης (гакис) — «крюк» или «крючковатый». Скорее всего, прозвище Гакис давали человеку с характерной внешностью: горбатым носом, сутулой фигурой или цепкими, «крючковатыми» пальцами. В переносном смысле так могли называть хитрого, цепкого человека или того, кто занимался ремёслами, связанными с крюками (рыбак, портной, кузнец).

В Российской империи фамилия Гакис встречается в основном в среде греческих переселенцев, особенно в Крыму и Приазовье, где с XVIII века существовали компактные греческие общины. После депортаций греческого населения в середине XX века часть носителей фамилии оказалась в Средней Азии, а затем разъехалась по разным регионам.

Интересная деталь: в некоторых документах XIX века фамилию могли записывать как «Гаккис» — с удвоенной «к», что точнее передавало греческое произношение. Но в русской бытовой речи двойная согласная быстро редуцировалась, и закрепился современный вариант. Сравните с фамилией «Гакис» в современной Греции: там она встречается в основном на островах и в материковой Фессалии, что подтверждает её исконно греческий, а не искусственный «кабинетный» характер.